Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms