Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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