Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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