Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20830J3KML6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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