Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm20828J3KMI7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm20828J3KMI7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm20828J3KMI7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm20828J3KMI7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm20828J3KMI7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20828J3KMI7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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