Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc4lG5E8X2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms