Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nccrp1G3X9C2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nccrp1G3X9C2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms