Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms