Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ercc6F8VPZ5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms