Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3371F7CQW8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3371F7CQW8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms