Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm28048F7BCN0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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