Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd7E9Q9W7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd7E9Q9W7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd7E9Q9W7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd7E9Q9W7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd7E9Q9W7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms