Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm5407E9Q7Q1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm5407E9Q7Q1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm5407E9Q7Q1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm5407E9Q7Q1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm5407E9Q7Q1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm5407E9Q7Q1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm5407E9Q7Q1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm5407E9Q7Q1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm5407E9Q7Q1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms