Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtproE9Q612 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms