Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20518E9Q548 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm20518E9Q548 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms