Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde8bE9Q4S1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms