Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NbasE9Q411 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms