Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Susd1E9Q3H4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Susd1E9Q3H4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd1E9Q3H4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms