Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3250E9Q1M3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm3250E9Q1M3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm3250E9Q1M3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3250E9Q1M3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms