Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myo5cE9Q1F5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo5cE9Q1F5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms