Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0A8

Krtap20-2, Keratin-associated protein 20-2, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap20-2E9Q0A8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Krtap20-2E9Q0A8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms