Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc144bE9PVZ3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms