Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30bE9PVL6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms