Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc175E9PVB3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms