Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cngb1E1AZ71 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cngb1E1AZ71 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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