Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms