Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5930D3Z257 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5930D3Z257 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5930D3Z257 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5930D3Z257 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5930D3Z257 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms