Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms