Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm4950D3YUM8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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