Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm20547B8JJN0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20547B8JJN0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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