Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Phf11bB4XVQ1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Phf11bB4XVQ1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Phf11bB4XVQ1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Phf11bB4XVQ1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Phf11bB4XVQ1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Phf11bB4XVQ1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Phf11bB4XVQ1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Phf11bB4XVQ1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11bB4XVQ1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Phf11bB4XVQ1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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