Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms