Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms