Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apba1B2RUJ5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms