Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7aB2RT54 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms