Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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