Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms