Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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