Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spocd1B1ASB6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms