Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3173A6NAS3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms