Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Rtf1A2AQ19 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Rtf1A2AQ19 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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