Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syndig1A2ANU3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms