Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lcn6A2AJB9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lcn6A2AJB9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms