Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col9a3A2ACT7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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