Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LHF2

Vsig10l2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10l2A0A140LHF2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig10l2A0A140LHF2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms