Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms