Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-BlV9GXR0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-BlV9GXR0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-BlV9GXR0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-BlV9GXR0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-BlV9GXR0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-BlV9GXR0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-BlV9GXR0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-BlV9GXR0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-BlV9GXR0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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