Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf3Q9Z2L7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf3Q9Z2L7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms