Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt16Q9Z2K1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms