Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn8Q9Z260 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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